Los mecanismos de aislamiento reproductivo son las barreras que bloquean el flujo génico entre dos poblaciones, y por cronología de acción se clasifican en:
- precigóticos
- postcigóticos
I. Los mecanismos precigóticos previenen la formación del cigoto:
Aislamiento reproductivo....Barrera de aislamiento reproductivo
* Ecológico: Ambientes diferentes. Agua dulce y agua salada, por ejemplo.
* Estacional: Desfase cronológico. Expresamente, cuando dos poblaciones se reproducen en diferentes estaciones del año.
* Etológico: Conducta segregatoria. Cuando dos poblaciones se comportan de tal modo que los individuos de una no se cruzan con los individuos de la otra.
* Sexual: Incompatibilidad de órganos reproductores.
* Gamético: Incompatibilidad de gametos.
II. Los mecanismos postcigóticos impiden el desarrollo de una progenie fértil, y resultan en:
- inviabilidad de híbridos
- esterilidad de híbridos
En vegetales, las semillas híbridas comúnmente no germinan.
En animales, el desarrollo puede ser abortivo o producir progenie estéril. Una mula, por ejemplo, es un híbrido estéril de la cruza de un burro y una yegua.