Aqui tienes algunas diferencias:
CUERPO VEGETATIVO
GIMNOSPERMAS :predominan formas leñosas
ANGIOSPERMAS :formas herbáceas y leñosas
RAMIFICACIÓN
GIMNOSPERMAS : monopódica
ANGIOSPERMAS : simpódica
LEÑO
GIMNOSPERMAS : formado por traqueidas
ANGIOSPERMAS : generalmente tráqueas y traqueidas
GAMETOFITO
GIMNOSPERMAS : masculino formado por varias células, femenino pluricelular
ANGIOSPERMAS : masculino 2(3) células ,femenino 8 células ó menos
ÓVULO
GIMNOSPERMAS :desnudo - unitégmicos
ANGIOSPERMAS : encerrado en el ovario - frecuentemente bitégmicos
POLINIZACIÓN
GIMNOSPERMAS : anemófila, directa - polen captado por el óvulo
ANGIOSPERMAS : entomófila, indirecta - polen captado por el estigma
FECUNDACIÓN
GIMNOSPERMAS :simple - arquegonio presente
ANGIOSPERMAS : doble - arquegonio ausente
SEMILLAS
GIMNOSPERMAS : desnuda - numerosos cotiledones
ANGIOSPERMAS : incluida en el fruto - 2 cotiledones ó 1
REPRODUCCIÓN SEXUAL
GIMNOSPERMAS : Muy lenta
ANGIOSPERMAS : rápida
Bueno espero haberte ayudado
Saludos